إحياء التراث الصوفي الأصيل والتعريف بكنوزه وذخائره وبيان فضله ومآثره من خلال جمع وفهرسة ودراسة وبحث وتحقيق وترجمة ونشر مخطوطاته وكتبه ومتونه.

تأصيل التصوف بما ينبه الأمة إلى استعادة هويتها وتوفير الرؤية الصحيحة لديها لمعالجة قضاياها المعاصرة في ضوء جذورها الفكرية ومنابعها الثقافية الإسلامية الأصيلة وذلك من خلال:

• النظر والفتوى والبحث والدراسة في القضايا الصوفية المختلفة وإقامة الأدلة الشرعية على أحكامها بكل الوسائل المتاحة كإصدار (سلاسل من البحوث المتنوعة) في التصوف كسلسلة التصوف الراشد، أو سلسلة قضايا وإشكالات التصوف، أو تاريخ التصوف أو رجال التصوف .... الخ.
• إصدار مجلة علمية محكمة للبحوث والدراسات الصوفية ... إلخ.
• متابعة البحوث والدراسات والكتب المتعلقة بالتصوف بالدراسة والبحث والتحليل في ضوء أصول التصوف وقواعده، وضوابط العلوم الشرعية والعقلية.
• طبع ونشر البحوث والدراسات الجادة في خدمة التصوف، وقضاياه .

إتاحة الفرصة للباحثين والدارسين لدراسة التصوف والتعرف عليه بأيسر السبل وأفضل الوسائل مع الاهتمام بتبويب موضوعاته وفهرستها على أبواب العلوم والأنشطة الحياتية، والعناية بتنقيته مما يخالف الكتاب والسنة ولا ينسجم مع واقع الحياة المعاصرة وأهداف ومقاصد الإسلام الدينية والدنيوية وذلك من خلال:

• العناية بالباحثين والمحققين المهتمين بدراسة علوم التصوف الإسلامي.
• تذليل العقبات المنهجية واللغوية في دراسة وبحث الإنتاج الفكري الصوفي.
• إنشاء دائرات المعارف والمعاجم الصوفية وغيرها من الموسوعات العلمية التى يحتاجها التأصيل العلمي للتصوف في مختلف العلوم مثال: أصول التفسير الصوفي وأدلته، أصول الأدب الصوفي، أصول الفقه الصوفي للأحكام، أصول الفقه الصوفي للحديث ... إلخ.
• العمل على جمع التراث الصوفي وفهرسته وتصنيفه وفقاً لضوابط علمية تكون نبراساً لتطوير الدراسات والبحوث في هذا التراث وتأصيل وتعظيم سبل الاستفادة منه.
• إنشاء مكتبة متخصصة في علوم التصوف، وتكون المرجع في كل ماله صلة بالتصوف ورجاله وعلومه.
• بناء خارطة معرفية للتصوف تبين اصوله وقواعده وفروعه ومجالاته وطرقه وإشكالاته وقضاياه ومناهج البحث فيه، وغير ذلك مما يشكل نبراساً للباحثين والدارسين فيه.

الارتقاء بالعمل الصوفي الحق، وتكوين كوادر صوفية واعية وقادرة على جمع الخلق على الحق، والربط بين الدين والدنيا ارتقاءً بالمستوى الصوفي عند أبناء التصوف وأحبائه والباحثين فيه، وتدريباً للدعاة إلى الله، وتصحيحاً للمفاهيم الخاطئة، ومواصلة لرسالة الدعوة والتربية الروحية الرشيدة من خلال:

• اقامة المعارض والملتقيات والفعاليات والأنشطة الصوفية المختلفة التى تعكس رقي التصوف وتبرز افاقه الحضارية وعمق فكره وثقافته.
• إقامة مراكز لتدريب دعاة التصوف وقادته وتنمية مهاراتهم الذاتية لمواكبة مقتضيات العصر وضرورات التجديد دون الإخلال بالأصول والمبادئ.
• تنظيم دورات ومحاضرات وجلسات نقاشية وندوات وورش عمل حول القضايا الصوفية المختلفة.

إنصاف أئمة التصوف بتحقيق تراجمهم وبيان مفاهيمهم ومقاصدهم وإصطلاحاتهم وشرحها وتذليلها وكشف ما غمض أو التبس منها.

تقديم التصوف الإسلامي الصحيح للعالم باعتباره الصورة المثلى للتطبيق العلمي للإسلام وكشف ممارسات أدعياء التصوف برده إلى حقائقه الأولى التى صنعت حضارة الأمة من خلال:

• المؤتمرات العالمية والمحلية والمنتديات الفكرية والندوات العلمية المتخصصة.
• الحضور الفعال في وسائل الإعلام المختلفة والمناسبات العلمية والثقافية المتنوعة بما يسمح بتحريك العقول الإسلامية الصوفية في سائر الأماكن ودفعها للعطاء من أجل تحقيق أهدافه.
• إجراء البحوث والدراسات الميدانية حول ممارسات أدعياء التصوف وانحرافات بعض العوام التى الصقت ظلماً بالتصوف وتقديم الحلول الكفيلة بالقضاء على مثل هذه الظواهر السلبية.

الربط بين الصوفية بمختلف بلدان العالم الإسلامي وتكثيف التعاون فيما بينهم وذلك من خلال:

• إنشاء بنك للمعلومات في المجال الصوفي الإسلامي يضم "الطرق الصوفية، شيوخها، أنشطتها، الشخصيات الصوفية، المؤتمرات، والندوات ... إلخ.
• إنشاء جهاز للعلاقات العامة والإعلام يتضمن التنسيق بين كافة الأجهزة والمراكز والهيئات الإسلامية في العالم خاصة الصوفية منها.
• عقد شراكات علمية مع الجامعات والمراكز البحثية ذات الاهتمام المشترك في الداخل والخارج.
• إنشاء موقع للمركز على شبكة الإنترنت يكون تابعاً لموقع الأكاديمية.

الدفاع عن التصوف بمتابعة ما يصدر عنه وحوله من برامج إعلامية مسموعة أو مرئية فضلاً عن كل ما يصدر من كتابات سواء أكانت كتباً أو نشرات أو تحقيقات صحيفية أو مقالات أو رسائل جامعية أو غير ذلك واتخاذ ما يلزم بشأنها تصحيحاً أو ترشيداً استناداً إلى الأسس العلمية والبحوث المحققة وإصدار المعلومات الخاصة بها لإفادة الباحثين في التصوف، والسماح لعلمائه بدحض شبهات خصومه، وبيان حقائقه البعيدة عن المفاهيم السطحية الساذجة أو المنحرفة وذلك عن طريق (جهاز المتابعة والتحليل).

العمل على تهيئة المناخ الملائم لعلاقات تعاون حضاري ايجابي بين الشرق والغر من خلال ترجمة روائع الفكر الصوفي وعلومه وآدابه إلى اللغات الحية بعد تحقيقه وتنقيحه ومن خلال نشره بكافة وسائل النشر الممكنة.

الحفاظ على التراث الصوفي المادي من زوايا وخنقاوات ومساجد واضرحة وسبل وكتاتيب وخلوات ومنتجات فنية، وذلك بالتعاون مع الوزارات والهيئات المختلفة كالآثار والسياحة والتضامن الاجتماعي والحكم المحلى والتعاون الدولي ... إلخ.

العمل على احياء البعد الصوفي للتراث الأصولى والفقهي واللغوي على نحو يجمع بين الشريعة والحقيقة ويصل الفقه والأصول بالطريقة وذلك من خلال:

• إجراء البحوث والدراسات المتخصصة في الكف عن الأبعاد الصوفية في المجالات المختلفة للعلوم الشرعية واللغوية.
• إنشاء الموسوعات العلمية التى يحتاجها التأصيل العلمى للتصوف في مختلف العلوم مثال: أصول التفسير الصوفي وأدلته، اصول الأدب الصوفي، اصول الفقه الصوفي للأحكام، اصول الفقه الصوفي للحديث ... إلخ.
• إجراء المسابقات لتشجيع الباحثين والدارسين في هذا المجال.
• إحياء مساجد ومراقد واضرحة علماء الأمة و اوليائها بتدريس تراثهم الذي خلفوه باضرحتهم دراسة متعمقة تشكل نسقاً علمياً متميزاً باعتباره كرسٍ علمي متخصص في الفرع المادى برع فيه هذا أو ذاك بحيث تتحول هذه المساجد والاضرحة إلى مراكز اشعاع علمى وفكري وثقافي و روحي.

للمركز فى سبيل تحقيق رسالته اتخاذ كافة الوسائل اللازمة ليكون مركز اشعاع علمي وفكري وثقافي وروحي خصوصًا ما يلى:

• إحياء مراقد ومساجد واضرحة علماء الأمة و أوليائها بتدريس تراثهم الذي خلفوه دراسة متعمقة تشكل نسقاً علمياً متميزاً باعتباره كرسياً متخصصاً في الفرع الذي برز فيه هذا وذاك الإمام.
• إحياء الآثار المصرية الكائنة بمصر عبر العصور المختلفة بالتعاون مع الوزارات المعنية كالآثار والسياحة والحكم المحلي والتضامن الاجتماعي وغيرها  من خلال عرض كافة مظاهر الحياة التى كانت سائدة في هذه العصور من سجاد وملابس وأوعية واثاث وزخارف وفنون وحرف وغير ذلك بما يعبر عن طبيعة الحياة الاجتماعية والسياسية والاقتصادية في هذه العصور.
• العمل على جمع التراث (الإسلامي) في (مجالات العلوم المختلفة) ووضع خطة متكاملة لفهرستها وتصنيفها تمهيداً لتحقيقها ودراستها ونشرها.
• إصدار البحوث والدراسات المتعمقة والمجلات والدوريات العلمية المتخصصة التى تخدم الأهداف المنصوص عليها سلفاً فى فروع العلوم المختلفة لكبار المفكرين والعلماء والأساتذة، مع ضرورة المحافظه على نشر نسخ من هذه الإصدارات باللغات الرئيسية العالمية قدر ماتسمح به إمكانات المركز.
• عقد المؤتمرات والمحاضرات المتخصصة والندوات والحلقات العلمية والنقاشية وغير ذلك من الأنشطة العلمية التى تندرج فى هذا السياق.
• تحقيق ودراسة وترجمة ونشر مخطوطات التراث العلمي الإسلامي في كافة المجالات بما يخدم رسالة المركز وإصدار البحوث والدراسات بشأنها.
• متابعة كافة البحوث والدراسات المتعلقة (بالعلوم الطبيعية والإنسانية والاجتماعية) وتحليلها وضبطها في ضوء اصوله وضوابطه وقواعده.
• العمل على تهيئة المناخ الملائم لعلاقات تعاون حضاري ايجابي بين الشرق والغرب من خلال تلمس مواطن التقارب وأسبابه، وبحث ودراسة إشكالات التعارض وقضايا الاختلاف توطئة لايجاد مساحات أكبر لتفاهم قوي راسخ وتعاون مثمر مؤات لسعادة البشرية جمعاء.
• الحفاظ على التراث الإسلامي الفكري والفني وغيره من أشكال التراث الأخرى ونشره بمختلف الوسائل المتاحة وترجمة روائعه إلى اللغات الحية بعد تحقيقه وتنقيحه ودراسته وتحليله.
• بناء خارطة معرفية في كل مجال من مجالات العلم تتضمن متطلبات البحث في التراث في ضوء واقع احتياجات الأمة وفقاً لقواعد كلية وأصول عامة تكون نبراساً للباحثين والدارسين.
• العمل على جمع وتوحيد الجهود الفردية والمؤسسية في مجال إحياء التراث من خلال إنشاء آلية مقبوله من الجميع تصب فيها هذه الجهود بما يعود على الأمة بالنفع والدوام.