مركز اللغات الأجنبية هو أحد المراكز التابعة للأكاديمية، الذي يستهدف تنمية مهارات اللغات الأجنبية من استماع، وتحدث، وقراءة، وكتابة، ومفردات، وقواعد، وترجمة، مع مراعاة الحفاظ على البعد الصوفي في المحتوى المقدم للدارسين، ويقوم بالتدريس فيه نخبة من الأساتذة المتميزين في هذا المجال، ويمنح المركز الدارسين شهادات معتمدة من الأكاديمية.